dailytechinfo.org>
Новая база данных, разработанная испанскими учеными-биологами, была помещена в открытый доступ. Теперь услугами этой базы могут воспользоваться все желающие, а основными ее пользователями станут ученые-фармацевты и биологи, разрабатывающие новые лекарственные препараты и методики лечения заболеваний. Эта база, имеющая название MoDEL, содержит данные о движениях более чем 1700 видов белковых молекул, входящих в состав человеческого организма, что делает ее самой крупной в мире базой данных в этой области.
База данных MoDEL была разработана на основе данных, полученных посредством интенсивных вычислений суперкомпьютера, находящегося в центре Barcelona Supercomputing Center. Используя эти данные и данные из международной базы данных Protein Data Bank (PDB) ученые создали новую базу, на этот раз базу не просто структуры белков, а видеоинформации, демонстрирующей движение белковых молекул. Каждый из 1700 видов белков, представленных в базе, демонстрируется, используя последовательность из 10000-100000 снимков, демонстрирующих движения и превращения сложной структуры белковых молекул. Конечно, 1700 из 40000 видов белков человеческого организма это не так уж и много, но и эта цифра представляет собой уже 40% от общего количества известных ученым белков с изученной структурой.
Так чем же примечательно создание такой базы? Благодаря собранным данным ученые-фармацевты смогут начать разрабатывать новые виды лекарственных препаратов, воздействие которых направлено исключительно на один или несколько видов белков, которые повреждаются в результате того или иного заболевания. Это область, где наработки, сделанные в течение прошедших двух десятилетий, только начинают приносить первые результаты, открывая перед людьми тайны человеческого генома и позволяя создавать новые методы лечения всевозможных заболеваний начиная от простуды и заканчивая онкологическими заболеваниями.
Эта новая база, доступная сейчас онлайн исследователям во всем мире, и насчитывающая только 1700 записей, является только первым шагом. По мере того, как в ходе различных исследований будут получены данные о новых видах белков, база MoDEL будет постоянно пополняться. По предварительным прогнозам уже через два-три года база MoDEL охватит до 80% всех белков человеческого организма.
PMDB Protein Model DataBase, which collects three dimensional protein models obtained by structure prediction methods.
Users can both contribute new models and search for existing ones. The database currently stores all models submitted to the last four editions of the CASP experiment
The mission of
UniProt is to provide the scientific community with a comprehensive, high-quality and freely accessible resource of protein sequence and functional information.
![[info]](http://l-stat.livejournal.com/img/userinfo.gif?v=92.2){kind=small}
nuclid's journal
